Index

A

AATS (class in mordred.Autocorrelation) AATSC (class in mordred.Autocorrelation) ABCGGIndex (class in mordred.ABCIndex) ABCIndex (class in mordred.ABCIndex) AcidicGroupCount (class in mordred.AcidBase) AdjacencyMatrix (class in mordred.AdjacencyMatrix) aggr_types (mordred.EState.AtomTypeEState attribute) APol (class in mordred.Polarizability) AromaticAtomsCount (class in mordred.Aromatic)

AromaticBondsCount (class in mordred.Aromatic) as_argument (mordred.Descriptor property) asdict() (mordred.Result method) AtomCount (class in mordred.AtomCount) atomic_sa() (mordred.surface_area.SurfaceArea method) AtomTypeEState (class in mordred.EState) ATS (class in mordred.Autocorrelation) ATSC (class in mordred.Autocorrelation) axes (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia attribute)

B

BalabanJ (class in mordred.BalabanJ) BaryszMatrix (class in mordred.BaryszMatrix) BasicGroupCount (class in mordred.AcidBase) BCUT (class in mordred.BCUT) BertzCT (class in mordred.BertzCT)

beta_types (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount attribute) bond_types (mordred.BondCount.BondCount attribute) BondCount (class in mordred.BondCount) BondingIC (class in mordred.InformationContent) BPol (class in mordred.Polarizability)

C

calculate() (mordred.Descriptor method) Calculator (class in mordred) CarbonTypes (class in mordred.CarbonTypes) Chi (class in mordred.Chi) chi_types (mordred.Chi.Chi attribute) compat_atoms (mordred.VdwVolumeABC.VdwVolumeABC attribute) ComplementaryIC (class in mordred.InformationContent) config (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex property) (mordred.ABCIndex.ABCIndex property) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount property) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount property) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix property) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount property) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount property) (mordred.AtomCount.AtomCount property) (mordred.Autocorrelation.AATS property) (mordred.Autocorrelation.AATSC property) (mordred.Autocorrelation.ATS property) (mordred.Autocorrelation.ATSC property) (mordred.Autocorrelation.GATS property) (mordred.Autocorrelation.MATS property) (mordred.BalabanJ.BalabanJ property) (mordred.BaryszMatrix.BaryszMatrix property) (mordred.BCUT.BCUT property) (mordred.BertzCT.BertzCT property) (mordred.BondCount.BondCount property) (mordred.CarbonTypes.CarbonTypes property) (mordred.CarbonTypes.FractionCSP3 property) (mordred.CarbonTypes.HybridizationRatio property) (mordred.Chi.Chi property) (mordred.Constitutional.ConstitutionalMean property) (mordred.Constitutional.ConstitutionalSum property) (mordred.CPSA.DPSA property) (mordred.CPSA.FNSA property) (mordred.CPSA.FPSA property) (mordred.CPSA.PNSA property) (mordred.CPSA.PPSA property) (mordred.CPSA.RASA property) (mordred.CPSA.RNCG property) (mordred.CPSA.RNCS property) (mordred.CPSA.RPCG property) (mordred.CPSA.RPCS property) (mordred.CPSA.RPSA property) (mordred.CPSA.TASA property) (mordred.CPSA.TPSA property) (mordred.CPSA.WNSA property) (mordred.CPSA.WPSA property) (mordred.DetourMatrix.DetourIndex property) (mordred.DetourMatrix.DetourMatrix property) (mordred.DistanceMatrix.DistanceMatrix property) (mordred.EccentricConnectivityIndex.EccentricConnectivityIndex property) (mordred.EState.AtomTypeEState property) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaBranchingIndex property) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCompositeIndex property) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCoreCount property) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha property) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaBeta property) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon property) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi property) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon property) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaFunctionalityIndex property) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaPsi property) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex property) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount property) (mordred.FragmentComplexity.FragmentComplexity property) (mordred.Framework.Framework property) (mordred.GeometricalIndex.Diameter3D property) (mordred.GeometricalIndex.GeometricalShapeIndex property) (mordred.GeometricalIndex.PetitjeanIndex3D property) (mordred.GeometricalIndex.Radius3D property) (mordred.GravitationalIndex.GravitationalIndex property) (mordred.HydrogenBond.HBondAcceptor property) (mordred.HydrogenBond.HBondDonor property) (mordred.InformationContent.BondingIC property) (mordred.InformationContent.ComplementaryIC property) (mordred.InformationContent.InformationContent property) (mordred.InformationContent.ModifiedIC property) (mordred.InformationContent.StructuralIC property) (mordred.InformationContent.TotalIC property) (mordred.InformationContent.ZModifiedIC property) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex1 property) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex2 property) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex3 property) (mordred.Lipinski.GhoseFilter property) (mordred.Lipinski.Lipinski property) (mordred.LogS.LogS property) (mordred.McGowanVolume.McGowanVolume property) (mordred.MoeType.EState_VSA property) (mordred.MoeType.LabuteASA property) (mordred.MoeType.PEOE_VSA property) (mordred.MoeType.SlogP_VSA property) (mordred.MoeType.SMR_VSA property) (mordred.MoeType.VSA_EState property) (mordred.MolecularDistanceEdge.MolecularDistanceEdge property) (mordred.MolecularId.MolecularId property) (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia property) (mordred.MoRSE.MoRSE property) (mordred.PathCount.PathCount property) (mordred.PBF.PBF property) (mordred.Polarizability.APol property) (mordred.Polarizability.BPol property) (mordred.RingCount.RingCount property) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsCount property) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsRatio property) (mordred.SLogP.SLogP property) (mordred.SLogP.SMR property) (mordred.TopologicalCharge.TopologicalCharge property) (mordred.TopologicalIndex.Diameter property) (mordred.TopologicalIndex.PetitjeanIndex property) (mordred.TopologicalIndex.Radius property) (mordred.TopologicalIndex.TopologicalShapeIndex property) (mordred.TopoPSA.TopoPSA property) (mordred.VdwVolumeABC.VdwVolumeABC property) (mordred.VertexAdjacencyInformation.VertexAdjacencyInformation property) (mordred.WalkCount.WalkCount property) (mordred.Weight.Weight property) (mordred.WienerIndex.WienerIndex property) (mordred.ZagrebIndex.ZagrebIndex property)

config() (mordred.Calculator method) ConstitutionalMean (class in mordred.Constitutional) ConstitutionalSum (class in mordred.Constitutional) coord (mordred.Descriptor property)

D

delta_epsilon_types (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon attribute) delta_psi_types (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi attribute) delta_types (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha attribute) dependencies() (mordred.Descriptor method) description() (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex method) (mordred.ABCIndex.ABCIndex method) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount method) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount method) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix method) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount method) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount method) (mordred.AtomCount.AtomCount method) (mordred.Autocorrelation.AATS method) (mordred.Autocorrelation.AATSC method) (mordred.Autocorrelation.ATS method) (mordred.Autocorrelation.ATSC method) (mordred.Autocorrelation.GATS method) (mordred.Autocorrelation.MATS method) (mordred.BalabanJ.BalabanJ method) (mordred.BaryszMatrix.BaryszMatrix method) (mordred.BCUT.BCUT method) (mordred.BertzCT.BertzCT method) (mordred.BondCount.BondCount method) (mordred.CarbonTypes.CarbonTypes method) (mordred.CarbonTypes.FractionCSP3 method) (mordred.CarbonTypes.HybridizationRatio method) (mordred.Chi.Chi method) (mordred.Constitutional.ConstitutionalMean method) (mordred.Constitutional.ConstitutionalSum method) (mordred.CPSA.DPSA method) (mordred.CPSA.FNSA method) (mordred.CPSA.FPSA method) (mordred.CPSA.PNSA method) (mordred.CPSA.PPSA method) (mordred.CPSA.RASA method) (mordred.CPSA.RNCG method) (mordred.CPSA.RNCS method) (mordred.CPSA.RPCG method) (mordred.CPSA.RPCS method) (mordred.CPSA.RPSA method) (mordred.CPSA.TASA method) (mordred.CPSA.TPSA method) (mordred.CPSA.WNSA method) (mordred.CPSA.WPSA method) (mordred.DetourMatrix.DetourIndex method) (mordred.DetourMatrix.DetourMatrix method) (mordred.DistanceMatrix.DistanceMatrix method) (mordred.EccentricConnectivityIndex.EccentricConnectivityIndex method) (mordred.EState.AtomTypeEState method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaBranchingIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCompositeIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCoreCount method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaBeta method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaFunctionalityIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaPsi method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount method) (mordred.FragmentComplexity.FragmentComplexity method) (mordred.Framework.Framework method) (mordred.GeometricalIndex.Diameter3D method) (mordred.GeometricalIndex.GeometricalShapeIndex method) (mordred.GeometricalIndex.PetitjeanIndex3D method) (mordred.GeometricalIndex.Radius3D method) (mordred.GravitationalIndex.GravitationalIndex method) (mordred.HydrogenBond.HBondAcceptor method) (mordred.HydrogenBond.HBondDonor method) (mordred.InformationContent.BondingIC method) (mordred.InformationContent.ComplementaryIC method) (mordred.InformationContent.InformationContent method) (mordred.InformationContent.ModifiedIC method) (mordred.InformationContent.StructuralIC method) (mordred.InformationContent.TotalIC method) (mordred.InformationContent.ZModifiedIC method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex1 method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex2 method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex3 method) (mordred.Lipinski.GhoseFilter method) (mordred.Lipinski.Lipinski method) (mordred.LogS.LogS method) (mordred.McGowanVolume.McGowanVolume method) (mordred.MoeType.EState_VSA method) (mordred.MoeType.LabuteASA method) (mordred.MoeType.PEOE_VSA method) (mordred.MoeType.SlogP_VSA method) (mordred.MoeType.SMR_VSA method) (mordred.MoeType.VSA_EState method) (mordred.MolecularDistanceEdge.MolecularDistanceEdge method) (mordred.MolecularId.MolecularId method) (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia method) (mordred.MoRSE.MoRSE method) (mordred.PathCount.PathCount method) (mordred.PBF.PBF method) (mordred.Polarizability.APol method) (mordred.Polarizability.BPol method) (mordred.RingCount.RingCount method) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsCount method) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsRatio method) (mordred.SLogP.SLogP method) (mordred.SLogP.SMR method) (mordred.TopologicalCharge.TopologicalCharge method) (mordred.TopologicalIndex.Diameter method) (mordred.TopologicalIndex.PetitjeanIndex method) (mordred.TopologicalIndex.Radius method) (mordred.TopologicalIndex.TopologicalShapeIndex method) (mordred.TopoPSA.TopoPSA method) (mordred.VdwVolumeABC.VdwVolumeABC method) (mordred.VertexAdjacencyInformation.VertexAdjacencyInformation method) (mordred.WalkCount.WalkCount method) (mordred.Weight.Weight method) (mordred.WienerIndex.WienerIndex method) (mordred.ZagrebIndex.ZagrebIndex method)

Descriptor (class in mordred) descriptors (mordred.Calculator property) DetourIndex (class in mordred.DetourMatrix) DetourMatrix (class in mordred.DetourMatrix) Diameter (class in mordred.TopologicalIndex) Diameter3D (class in mordred.GeometricalIndex) DistanceMatrix (class in mordred.DistanceMatrix) DPSA (class in mordred.CPSA) drop_missing() (mordred.Result method) DuplicatedDescriptorName

E

EccentricConnectivityIndex (class in mordred.EccentricConnectivityIndex) echo() (mordred.Calculator method) epsilon_types (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon attribute) Error (class in mordred.error) error (mordred.error.MissingValueBase attribute) es_types (mordred.EState.AtomTypeEState attribute) EState_VSA (class in mordred.MoeType) EtaBranchingIndex (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaCompositeIndex (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaCoreCount (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaDeltaAlpha (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaDeltaBeta (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaDeltaEpsilon (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaDeltaPsi (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaEpsilon (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaFunctionalityIndex (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaPsi (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaShapeIndex (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaVEMCount (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) explicit_hydrogens (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex attribute) (mordred.ABCIndex.ABCIndex attribute) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount attribute) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount attribute) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix attribute) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount attribute) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount attribute) (mordred.AtomCount.AtomCount property) (mordred.Autocorrelation.AATS attribute) (mordred.Autocorrelation.AATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.ATS attribute) (mordred.Autocorrelation.ATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.GATS attribute) (mordred.Autocorrelation.MATS attribute) (mordred.BalabanJ.BalabanJ attribute) (mordred.BaryszMatrix.BaryszMatrix attribute) (mordred.BCUT.BCUT attribute) (mordred.BertzCT.BertzCT attribute) (mordred.BondCount.BondCount property) (mordred.CarbonTypes.CarbonTypes attribute) (mordred.CarbonTypes.FractionCSP3 attribute) (mordred.CarbonTypes.HybridizationRatio attribute) (mordred.Chi.Chi attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalMean attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalSum attribute) (mordred.CPSA.DPSA attribute) (mordred.CPSA.FNSA attribute) (mordred.CPSA.FPSA attribute) (mordred.CPSA.PNSA attribute) (mordred.CPSA.PPSA attribute) (mordred.CPSA.RASA attribute) (mordred.CPSA.RNCG attribute) (mordred.CPSA.RNCS attribute) (mordred.CPSA.RPCG attribute) (mordred.CPSA.RPCS attribute) (mordred.CPSA.RPSA attribute) (mordred.CPSA.TASA attribute) (mordred.CPSA.TPSA attribute) (mordred.CPSA.WNSA attribute) (mordred.CPSA.WPSA attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourIndex attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourMatrix attribute) (mordred.DistanceMatrix.DistanceMatrix attribute) (mordred.EccentricConnectivityIndex.EccentricConnectivityIndex attribute) (mordred.EState.AtomTypeEState attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaBranchingIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCompositeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCoreCount attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaBeta attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon property) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaFunctionalityIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount attribute) (mordred.FragmentComplexity.FragmentComplexity attribute) (mordred.Framework.Framework attribute) (mordred.GeometricalIndex.Diameter3D attribute) (mordred.GeometricalIndex.GeometricalShapeIndex attribute) (mordred.GeometricalIndex.PetitjeanIndex3D attribute) (mordred.GeometricalIndex.Radius3D attribute) (mordred.GravitationalIndex.GravitationalIndex property) (mordred.HydrogenBond.HBondAcceptor attribute) (mordred.HydrogenBond.HBondDonor attribute) (mordred.InformationContent.BondingIC attribute) (mordred.InformationContent.ComplementaryIC attribute) (mordred.InformationContent.InformationContent attribute) (mordred.InformationContent.ModifiedIC attribute) (mordred.InformationContent.StructuralIC attribute) (mordred.InformationContent.TotalIC attribute) (mordred.InformationContent.ZModifiedIC attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex1 attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex2 attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex3 attribute) (mordred.Lipinski.GhoseFilter attribute) (mordred.Lipinski.Lipinski attribute) (mordred.LogS.LogS attribute) (mordred.McGowanVolume.McGowanVolume attribute) (mordred.MoeType.EState_VSA attribute) (mordred.MoeType.LabuteASA attribute) (mordred.MoeType.PEOE_VSA attribute) (mordred.MoeType.SlogP_VSA attribute) (mordred.MoeType.SMR_VSA attribute) (mordred.MoeType.VSA_EState attribute) (mordred.MolecularDistanceEdge.MolecularDistanceEdge attribute) (mordred.MolecularId.MolecularId attribute) (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia attribute) (mordred.MoRSE.MoRSE attribute) (mordred.PathCount.PathCount attribute) (mordred.PBF.PBF attribute) (mordred.Polarizability.APol attribute) (mordred.Polarizability.BPol attribute) (mordred.RingCount.RingCount attribute) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsCount attribute) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsRatio attribute) (mordred.SLogP.SLogP attribute) (mordred.SLogP.SMR attribute) (mordred.TopologicalCharge.TopologicalCharge attribute) (mordred.TopologicalIndex.Diameter attribute) (mordred.TopologicalIndex.PetitjeanIndex attribute) (mordred.TopologicalIndex.Radius attribute) (mordred.TopologicalIndex.TopologicalShapeIndex attribute) (mordred.TopoPSA.TopoPSA attribute) (mordred.VdwVolumeABC.VdwVolumeABC attribute) (mordred.VertexAdjacencyInformation.VertexAdjacencyInformation attribute) (mordred.WalkCount.WalkCount attribute) (mordred.Weight.Weight attribute) (mordred.WienerIndex.WienerIndex attribute) (mordred.ZagrebIndex.ZagrebIndex attribute)

F

fail() (mordred.Descriptor method) fill_missing() (mordred.Result method) FNSA (class in mordred.CPSA) FPSA (class in mordred.CPSA) FractionCSP3 (class in mordred.CarbonTypes) FragmentComplexity (class in mordred.FragmentComplexity) Framework (class in mordred.Framework) from_json() (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex class method) (mordred.ABCIndex.ABCIndex class method) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount class method) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount class method) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix class method) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount class method) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount class method) (mordred.AtomCount.AtomCount class method) (mordred.Autocorrelation.AATS class method) (mordred.Autocorrelation.AATSC class method) (mordred.Autocorrelation.ATS class method) (mordred.Autocorrelation.ATSC class method) (mordred.Autocorrelation.GATS class method) (mordred.Autocorrelation.MATS class method) (mordred.BalabanJ.BalabanJ class method) (mordred.BaryszMatrix.BaryszMatrix class method) (mordred.BCUT.BCUT class method) (mordred.BertzCT.BertzCT class method) (mordred.BondCount.BondCount class method) (mordred.Calculator class method) (mordred.CarbonTypes.CarbonTypes class method) (mordred.CarbonTypes.FractionCSP3 class method) (mordred.CarbonTypes.HybridizationRatio class method) (mordred.Chi.Chi class method) (mordred.Constitutional.ConstitutionalMean class method) (mordred.Constitutional.ConstitutionalSum class method) (mordred.CPSA.DPSA class method) (mordred.CPSA.FNSA class method) (mordred.CPSA.FPSA class method) (mordred.CPSA.PNSA class method) (mordred.CPSA.PPSA class method) (mordred.CPSA.RASA class method) (mordred.CPSA.RNCG class method) (mordred.CPSA.RNCS class method) (mordred.CPSA.RPCG class method) (mordred.CPSA.RPCS class method) (mordred.CPSA.RPSA class method) (mordred.CPSA.TASA class method) (mordred.CPSA.TPSA class method) (mordred.CPSA.WNSA class method) (mordred.CPSA.WPSA class method) (mordred.Descriptor class method) (mordred.DetourMatrix.DetourIndex class method) (mordred.DetourMatrix.DetourMatrix class method) (mordred.DistanceMatrix.DistanceMatrix class method) (mordred.EccentricConnectivityIndex.EccentricConnectivityIndex class method) (mordred.EState.AtomTypeEState class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaBranchingIndex class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCompositeIndex class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCoreCount class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaBeta class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaFunctionalityIndex class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaPsi class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount class method) (mordred.FragmentComplexity.FragmentComplexity class method) (mordred.Framework.Framework class method) (mordred.GeometricalIndex.Diameter3D class method) (mordred.GeometricalIndex.GeometricalShapeIndex class method) (mordred.GeometricalIndex.PetitjeanIndex3D class method) (mordred.GeometricalIndex.Radius3D class method) (mordred.GravitationalIndex.GravitationalIndex class method) (mordred.HydrogenBond.HBondAcceptor class method) (mordred.HydrogenBond.HBondDonor class method) (mordred.InformationContent.BondingIC class method) (mordred.InformationContent.ComplementaryIC class method) (mordred.InformationContent.InformationContent class method) (mordred.InformationContent.ModifiedIC class method) (mordred.InformationContent.StructuralIC class method) (mordred.InformationContent.TotalIC class method) (mordred.InformationContent.ZModifiedIC class method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex1 class method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex2 class method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex3 class method) (mordred.Lipinski.GhoseFilter class method) (mordred.Lipinski.Lipinski class method) (mordred.LogS.LogS class method) (mordred.McGowanVolume.McGowanVolume class method) (mordred.MoeType.EState_VSA class method) (mordred.MoeType.LabuteASA class method) (mordred.MoeType.PEOE_VSA class method) (mordred.MoeType.SlogP_VSA class method) (mordred.MoeType.SMR_VSA class method) (mordred.MoeType.VSA_EState class method) (mordred.MolecularDistanceEdge.MolecularDistanceEdge class method) (mordred.MolecularId.MolecularId class method) (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia class method) (mordred.MoRSE.MoRSE class method) (mordred.PathCount.PathCount class method) (mordred.PBF.PBF class method) (mordred.Polarizability.APol class method) (mordred.Polarizability.BPol class method) (mordred.RingCount.RingCount class method) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsCount class method) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsRatio class method) (mordred.SLogP.SLogP class method) (mordred.SLogP.SMR class method) (mordred.TopologicalCharge.TopologicalCharge class method) (mordred.TopologicalIndex.Diameter class method) (mordred.TopologicalIndex.PetitjeanIndex class method) (mordred.TopologicalIndex.Radius class method) (mordred.TopologicalIndex.TopologicalShapeIndex class method) (mordred.TopoPSA.TopoPSA class method) (mordred.VdwVolumeABC.VdwVolumeABC class method) (mordred.VertexAdjacencyInformation.VertexAdjacencyInformation class method) (mordred.WalkCount.WalkCount class method) (mordred.Weight.Weight class method) (mordred.WienerIndex.WienerIndex class method) (mordred.ZagrebIndex.ZagrebIndex class method)

from_mol() (mordred.surface_area.SurfaceArea class method) from_pdb() (mordred.surface_area.SurfaceArea class method)

G

GATS (class in mordred.Autocorrelation) GeometricalShapeIndex (class in mordred.GeometricalIndex) get_3D_mol() (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex method) (mordred.ABCIndex.ABCIndex method) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount method) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount method) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix method) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount method) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount method) (mordred.AtomCount.AtomCount method) (mordred.Autocorrelation.AATS method) (mordred.Autocorrelation.AATSC method) (mordred.Autocorrelation.ATS method) (mordred.Autocorrelation.ATSC method) (mordred.Autocorrelation.GATS method) (mordred.Autocorrelation.MATS method) (mordred.BalabanJ.BalabanJ method) (mordred.BaryszMatrix.BaryszMatrix method) (mordred.BCUT.BCUT method) (mordred.BertzCT.BertzCT method) (mordred.BondCount.BondCount method) (mordred.CarbonTypes.CarbonTypes method) (mordred.CarbonTypes.FractionCSP3 method) (mordred.CarbonTypes.HybridizationRatio method) (mordred.Chi.Chi method) (mordred.Constitutional.ConstitutionalMean method) (mordred.Constitutional.ConstitutionalSum method) (mordred.CPSA.DPSA method) (mordred.CPSA.FNSA method) (mordred.CPSA.FPSA method) (mordred.CPSA.PNSA method) (mordred.CPSA.PPSA method) (mordred.CPSA.RASA method) (mordred.CPSA.RNCG method) (mordred.CPSA.RNCS method) (mordred.CPSA.RPCG method) (mordred.CPSA.RPCS method) (mordred.CPSA.RPSA method) (mordred.CPSA.TASA method) (mordred.CPSA.TPSA method) (mordred.CPSA.WNSA method) (mordred.CPSA.WPSA method) (mordred.DetourMatrix.DetourIndex method) (mordred.DetourMatrix.DetourMatrix method) (mordred.DistanceMatrix.DistanceMatrix method) (mordred.EccentricConnectivityIndex.EccentricConnectivityIndex method) (mordred.EState.AtomTypeEState method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaBranchingIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCompositeIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCoreCount method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaBeta method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaFunctionalityIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaPsi method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount method) (mordred.FragmentComplexity.FragmentComplexity method) (mordred.Framework.Framework method) (mordred.GeometricalIndex.Diameter3D method) (mordred.GeometricalIndex.GeometricalShapeIndex method) (mordred.GeometricalIndex.PetitjeanIndex3D method) (mordred.GeometricalIndex.Radius3D method) (mordred.GravitationalIndex.GravitationalIndex method) (mordred.HydrogenBond.HBondAcceptor method) (mordred.HydrogenBond.HBondDonor method) (mordred.InformationContent.BondingIC method) (mordred.InformationContent.ComplementaryIC method) (mordred.InformationContent.InformationContent method) (mordred.InformationContent.ModifiedIC method) (mordred.InformationContent.StructuralIC method) (mordred.InformationContent.TotalIC method) (mordred.InformationContent.ZModifiedIC method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex1 method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex2 method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex3 method) (mordred.Lipinski.GhoseFilter method) (mordred.Lipinski.Lipinski method) (mordred.LogS.LogS method) (mordred.McGowanVolume.McGowanVolume method) (mordred.MoeType.EState_VSA method) (mordred.MoeType.LabuteASA method) (mordred.MoeType.PEOE_VSA method) (mordred.MoeType.SlogP_VSA method) (mordred.MoeType.SMR_VSA method) (mordred.MoeType.VSA_EState method) (mordred.MolecularDistanceEdge.MolecularDistanceEdge method) (mordred.MolecularId.MolecularId method) (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia method) (mordred.MoRSE.MoRSE method) (mordred.PathCount.PathCount method) (mordred.PBF.PBF method) (mordred.Polarizability.APol method) (mordred.Polarizability.BPol method) (mordred.RingCount.RingCount method) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsCount method) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsRatio method) (mordred.SLogP.SLogP method) (mordred.SLogP.SMR method) (mordred.TopologicalCharge.TopologicalCharge method) (mordred.TopologicalIndex.Diameter method) (mordred.TopologicalIndex.PetitjeanIndex method) (mordred.TopologicalIndex.Radius method) (mordred.TopologicalIndex.TopologicalShapeIndex method) (mordred.TopoPSA.TopoPSA method) (mordred.VdwVolumeABC.VdwVolumeABC method) (mordred.VertexAdjacencyInformation.VertexAdjacencyInformation method) (mordred.WalkCount.WalkCount method) (mordred.Weight.Weight method) (mordred.WienerIndex.WienerIndex method) (mordred.ZagrebIndex.ZagrebIndex method)

get_descriptors_in_module() (in module mordred) get_parameter_dict() (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex method) (mordred.ABCIndex.ABCIndex method) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount method) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount method) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix method) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount method) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount method) (mordred.AtomCount.AtomCount method) (mordred.Autocorrelation.AATS method) (mordred.Autocorrelation.AATSC method) (mordred.Autocorrelation.ATS method) (mordred.Autocorrelation.ATSC method) (mordred.Autocorrelation.GATS method) (mordred.Autocorrelation.MATS method) (mordred.BalabanJ.BalabanJ method) (mordred.BaryszMatrix.BaryszMatrix method) (mordred.BCUT.BCUT method) (mordred.BertzCT.BertzCT method) (mordred.BondCount.BondCount method) (mordred.CarbonTypes.CarbonTypes method) (mordred.CarbonTypes.FractionCSP3 method) (mordred.CarbonTypes.HybridizationRatio method) (mordred.Chi.Chi method) (mordred.Constitutional.ConstitutionalMean method) (mordred.Constitutional.ConstitutionalSum method) (mordred.CPSA.DPSA method) (mordred.CPSA.FNSA method) (mordred.CPSA.FPSA method) (mordred.CPSA.PNSA method) (mordred.CPSA.PPSA method) (mordred.CPSA.RASA method) (mordred.CPSA.RNCG method) (mordred.CPSA.RNCS method) (mordred.CPSA.RPCG method) (mordred.CPSA.RPCS method) (mordred.CPSA.RPSA method) (mordred.CPSA.TASA method) (mordred.CPSA.TPSA method) (mordred.CPSA.WNSA method) (mordred.CPSA.WPSA method) (mordred.DetourMatrix.DetourIndex method) (mordred.DetourMatrix.DetourMatrix method) (mordred.DistanceMatrix.DistanceMatrix method) (mordred.EccentricConnectivityIndex.EccentricConnectivityIndex method) (mordred.EState.AtomTypeEState method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaBranchingIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCompositeIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCoreCount method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaBeta method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaFunctionalityIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaPsi method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount method) (mordred.FragmentComplexity.FragmentComplexity method) (mordred.Framework.Framework method) (mordred.GeometricalIndex.Diameter3D method) (mordred.GeometricalIndex.GeometricalShapeIndex method) (mordred.GeometricalIndex.PetitjeanIndex3D method) (mordred.GeometricalIndex.Radius3D method) (mordred.GravitationalIndex.GravitationalIndex method) (mordred.HydrogenBond.HBondAcceptor method) (mordred.HydrogenBond.HBondDonor method) (mordred.InformationContent.BondingIC method) (mordred.InformationContent.ComplementaryIC method) (mordred.InformationContent.InformationContent method) (mordred.InformationContent.ModifiedIC method) (mordred.InformationContent.StructuralIC method) (mordred.InformationContent.TotalIC method) (mordred.InformationContent.ZModifiedIC method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex1 method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex2 method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex3 method) (mordred.Lipinski.GhoseFilter method) (mordred.Lipinski.Lipinski method) (mordred.LogS.LogS method) (mordred.McGowanVolume.McGowanVolume method) (mordred.MoeType.EState_VSA method) (mordred.MoeType.LabuteASA method) (mordred.MoeType.PEOE_VSA method) (mordred.MoeType.SlogP_VSA method) (mordred.MoeType.SMR_VSA method) (mordred.MoeType.VSA_EState method) (mordred.MolecularDistanceEdge.MolecularDistanceEdge method) (mordred.MolecularId.MolecularId method) (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia method) (mordred.MoRSE.MoRSE method) (mordred.PathCount.PathCount method) (mordred.PBF.PBF method) (mordred.Polarizability.APol method) (mordred.Polarizability.BPol method) (mordred.RingCount.RingCount method) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsCount method) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsRatio method) (mordred.SLogP.SLogP method) (mordred.SLogP.SMR method) (mordred.TopologicalCharge.TopologicalCharge method) (mordred.TopologicalIndex.Diameter method) (mordred.TopologicalIndex.PetitjeanIndex method) (mordred.TopologicalIndex.Radius method) (mordred.TopologicalIndex.TopologicalShapeIndex method) (mordred.TopoPSA.TopoPSA method) (mordred.VdwVolumeABC.VdwVolumeABC method) (mordred.VertexAdjacencyInformation.VertexAdjacencyInformation method) (mordred.WalkCount.WalkCount method) (mordred.Weight.Weight method) (mordred.WienerIndex.WienerIndex method) (mordred.ZagrebIndex.ZagrebIndex method) GhoseFilter (class in mordred.Lipinski) GravitationalIndex (class in mordred.GravitationalIndex)

H

HBondAcceptor (class in mordred.HydrogenBond) HBondDonor (class in mordred.HydrogenBond) header (mordred.error.Error attribute) (mordred.error.Missing attribute) (mordred.error.MissingValueBase property)

HybridizationRatio (class in mordred.CarbonTypes)

I

InformationContent (class in mordred.InformationContent)

items() (mordred.Result method) ix (mordred.Result property)

K

k_max (mordred.MoeType.EState_VSA attribute) (mordred.MoeType.PEOE_VSA attribute) (mordred.MoeType.SlogP_VSA attribute) (mordred.MoeType.SMR_VSA attribute) (mordred.MoeType.VSA_EState attribute) KappaShapeIndex1 (class in mordred.KappaShapeIndex) KappaShapeIndex2 (class in mordred.KappaShapeIndex) KappaShapeIndex3 (class in mordred.KappaShapeIndex) kekulize (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex attribute) (mordred.ABCIndex.ABCIndex attribute) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount attribute) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount attribute) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix attribute) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount attribute) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount attribute) (mordred.AtomCount.AtomCount attribute) (mordred.Autocorrelation.AATS attribute) (mordred.Autocorrelation.AATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.ATS attribute) (mordred.Autocorrelation.ATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.GATS attribute) (mordred.Autocorrelation.MATS attribute) (mordred.BalabanJ.BalabanJ attribute) (mordred.BaryszMatrix.BaryszMatrix attribute) (mordred.BCUT.BCUT attribute) (mordred.BertzCT.BertzCT attribute) (mordred.BondCount.BondCount attribute) (mordred.CarbonTypes.CarbonTypes attribute) (mordred.CarbonTypes.FractionCSP3 attribute) (mordred.CarbonTypes.HybridizationRatio attribute) (mordred.Chi.Chi attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalMean attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalSum attribute) (mordred.CPSA.DPSA attribute) (mordred.CPSA.FNSA attribute) (mordred.CPSA.FPSA attribute) (mordred.CPSA.PNSA attribute) (mordred.CPSA.PPSA attribute) (mordred.CPSA.RASA attribute) (mordred.CPSA.RNCG attribute) (mordred.CPSA.RNCS attribute) (mordred.CPSA.RPCG attribute) (mordred.CPSA.RPCS attribute) (mordred.CPSA.RPSA attribute) (mordred.CPSA.TASA attribute) (mordred.CPSA.TPSA attribute) (mordred.CPSA.WNSA attribute) (mordred.CPSA.WPSA attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourIndex attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourMatrix attribute) (mordred.DistanceMatrix.DistanceMatrix attribute) (mordred.EccentricConnectivityIndex.EccentricConnectivityIndex attribute) (mordred.EState.AtomTypeEState attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaBranchingIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCompositeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCoreCount attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaBeta attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaFunctionalityIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount attribute) (mordred.FragmentComplexity.FragmentComplexity attribute) (mordred.Framework.Framework attribute) (mordred.GeometricalIndex.Diameter3D attribute) (mordred.GeometricalIndex.GeometricalShapeIndex attribute) (mordred.GeometricalIndex.PetitjeanIndex3D attribute) (mordred.GeometricalIndex.Radius3D attribute) (mordred.GravitationalIndex.GravitationalIndex attribute) (mordred.HydrogenBond.HBondAcceptor attribute) (mordred.HydrogenBond.HBondDonor attribute) (mordred.InformationContent.BondingIC attribute) (mordred.InformationContent.ComplementaryIC attribute) (mordred.InformationContent.InformationContent attribute) (mordred.InformationContent.ModifiedIC attribute) (mordred.InformationContent.StructuralIC attribute) (mordred.InformationContent.TotalIC attribute) (mordred.InformationContent.ZModifiedIC attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex1 attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex2 attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex3 attribute) (mordred.Lipinski.GhoseFilter attribute) (mordred.Lipinski.Lipinski attribute) (mordred.LogS.LogS attribute) (mordred.McGowanVolume.McGowanVolume attribute) (mordred.MoeType.EState_VSA attribute) (mordred.MoeType.LabuteASA attribute) (mordred.MoeType.PEOE_VSA attribute) (mordred.MoeType.SlogP_VSA attribute) (mordred.MoeType.SMR_VSA attribute) (mordred.MoeType.VSA_EState attribute) (mordred.MolecularDistanceEdge.MolecularDistanceEdge attribute) (mordred.MolecularId.MolecularId attribute) (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia attribute) (mordred.MoRSE.MoRSE attribute) (mordred.PathCount.PathCount attribute) (mordred.PBF.PBF attribute) (mordred.Polarizability.APol attribute) (mordred.Polarizability.BPol attribute) (mordred.RingCount.RingCount attribute) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsCount attribute) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsRatio attribute) (mordred.SLogP.SLogP attribute) (mordred.SLogP.SMR attribute) (mordred.TopologicalCharge.TopologicalCharge attribute) (mordred.TopologicalIndex.Diameter attribute) (mordred.TopologicalIndex.PetitjeanIndex attribute) (mordred.TopologicalIndex.Radius attribute) (mordred.TopologicalIndex.TopologicalShapeIndex attribute) (mordred.TopoPSA.TopoPSA attribute) (mordred.VdwVolumeABC.VdwVolumeABC attribute) (mordred.VertexAdjacencyInformation.VertexAdjacencyInformation attribute) (mordred.WalkCount.WalkCount attribute) (mordred.Weight.Weight attribute) (mordred.WienerIndex.WienerIndex attribute) (mordred.ZagrebIndex.ZagrebIndex attribute)

keys() (mordred.Result method)

L

LabuteASA (class in mordred.MoeType)

Lipinski (class in mordred.Lipinski) LogS (class in mordred.LogS)

M

map() (mordred.Calculator method) MATS (class in mordred.Autocorrelation) McGowanVolume (class in mordred.McGowanVolume) Missing (class in mordred.error) Missing3DCoordinate MissingValueBase (class in mordred.error) ModifiedIC (class in mordred.InformationContent) module mordred mordred.ABCIndex mordred.AcidBase mordred.AdjacencyMatrix mordred.Aromatic mordred.AtomCount mordred.Autocorrelation mordred.BalabanJ mordred.BaryszMatrix mordred.BCUT mordred.BertzCT mordred.BondCount mordred.CarbonTypes mordred.Chi mordred.Constitutional mordred.CPSA mordred.descriptors mordred.DetourMatrix mordred.DistanceMatrix mordred.EccentricConnectivityIndex mordred.error mordred.EState mordred.ExtendedTopochemicalAtom mordred.FragmentComplexity mordred.Framework mordred.GeometricalIndex mordred.GravitationalIndex mordred.HydrogenBond mordred.InformationContent mordred.KappaShapeIndex mordred.Lipinski mordred.LogS mordred.McGowanVolume mordred.MoeType mordred.MolecularDistanceEdge mordred.MolecularId mordred.MomentOfInertia mordred.MoRSE mordred.PathCount mordred.PBF mordred.Polarizability mordred.RingCount mordred.RotatableBond mordred.SLogP mordred.surface_area mordred.TopologicalCharge mordred.TopologicalIndex mordred.TopoPSA mordred.VdwVolumeABC mordred.VertexAdjacencyInformation mordred.WalkCount mordred.Weight mordred.WienerIndex mordred.ZagrebIndex mol (mordred.Descriptor attribute) (mordred.Descriptor property) MolecularDistanceEdge (class in mordred.MolecularDistanceEdge) MolecularId (class in mordred.MolecularId) MomentOfInertia (class in mordred.MomentOfInertia) mordred module mordred.ABCIndex module mordred.AcidBase module mordred.AdjacencyMatrix module mordred.Aromatic module mordred.AtomCount module mordred.Autocorrelation module mordred.BalabanJ module mordred.BaryszMatrix module mordred.BCUT module mordred.BertzCT module

mordred.BondCount module mordred.CarbonTypes module mordred.Chi module mordred.Constitutional module mordred.CPSA module mordred.descriptors module mordred.DetourMatrix module mordred.DistanceMatrix module mordred.EccentricConnectivityIndex module mordred.error module mordred.EState module mordred.ExtendedTopochemicalAtom module mordred.FragmentComplexity module mordred.Framework module mordred.GeometricalIndex module mordred.GravitationalIndex module mordred.HydrogenBond module mordred.InformationContent module mordred.KappaShapeIndex module mordred.Lipinski module mordred.LogS module mordred.McGowanVolume module mordred.MoeType module mordred.MolecularDistanceEdge module mordred.MolecularId module mordred.MomentOfInertia module mordred.MoRSE module mordred.PathCount module mordred.PBF module mordred.Polarizability module mordred.RingCount module mordred.RotatableBond module mordred.SLogP module mordred.surface_area module mordred.TopologicalCharge module mordred.TopologicalIndex module mordred.TopoPSA module mordred.VdwVolumeABC module mordred.VertexAdjacencyInformation module mordred.WalkCount module mordred.Weight module mordred.WienerIndex module mordred.ZagrebIndex module MordredException MoRSE (class in mordred.MoRSE) MultipleFragments

N

name (mordred.Result property)

P

pandas() (mordred.Calculator method) parameter_names (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex attribute) (mordred.ABCIndex.ABCIndex attribute) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount attribute) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount attribute) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix attribute) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount attribute) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount attribute) (mordred.AtomCount.AtomCount attribute) (mordred.Autocorrelation.AATS attribute) (mordred.Autocorrelation.AATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.ATS attribute) (mordred.Autocorrelation.ATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.GATS attribute) (mordred.Autocorrelation.MATS attribute) (mordred.BalabanJ.BalabanJ attribute) (mordred.BaryszMatrix.BaryszMatrix attribute) (mordred.BCUT.BCUT attribute) (mordred.BertzCT.BertzCT attribute) (mordred.BondCount.BondCount attribute) (mordred.CarbonTypes.CarbonTypes attribute) (mordred.CarbonTypes.FractionCSP3 attribute) (mordred.CarbonTypes.HybridizationRatio attribute) (mordred.Chi.Chi attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalMean attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalSum attribute) (mordred.CPSA.DPSA attribute) (mordred.CPSA.FNSA attribute) (mordred.CPSA.FPSA attribute) (mordred.CPSA.PNSA attribute) (mordred.CPSA.PPSA attribute) (mordred.CPSA.RASA attribute) (mordred.CPSA.RNCG attribute) (mordred.CPSA.RNCS attribute) (mordred.CPSA.RPCG attribute) (mordred.CPSA.RPCS attribute) (mordred.CPSA.RPSA attribute) (mordred.CPSA.TASA attribute) (mordred.CPSA.TPSA attribute) (mordred.CPSA.WNSA attribute) (mordred.CPSA.WPSA attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourIndex attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourMatrix attribute) (mordred.DistanceMatrix.DistanceMatrix attribute) (mordred.EccentricConnectivityIndex.EccentricConnectivityIndex attribute) (mordred.EState.AtomTypeEState attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaBranchingIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCompositeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCoreCount attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaBeta attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaFunctionalityIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount attribute) (mordred.FragmentComplexity.FragmentComplexity attribute) (mordred.Framework.Framework attribute) (mordred.GeometricalIndex.Diameter3D attribute) (mordred.GeometricalIndex.GeometricalShapeIndex attribute) (mordred.GeometricalIndex.PetitjeanIndex3D attribute) (mordred.GeometricalIndex.Radius3D attribute) (mordred.GravitationalIndex.GravitationalIndex attribute) (mordred.HydrogenBond.HBondAcceptor attribute) (mordred.HydrogenBond.HBondDonor attribute) (mordred.InformationContent.BondingIC attribute) (mordred.InformationContent.ComplementaryIC attribute) (mordred.InformationContent.InformationContent attribute) (mordred.InformationContent.ModifiedIC attribute) (mordred.InformationContent.StructuralIC attribute) (mordred.InformationContent.TotalIC attribute) (mordred.InformationContent.ZModifiedIC attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex1 attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex2 attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex3 attribute) (mordred.Lipinski.GhoseFilter attribute) (mordred.Lipinski.Lipinski attribute) (mordred.LogS.LogS attribute) (mordred.McGowanVolume.McGowanVolume attribute) (mordred.MoeType.EState_VSA attribute) (mordred.MoeType.LabuteASA attribute) (mordred.MoeType.PEOE_VSA attribute) (mordred.MoeType.SlogP_VSA attribute) (mordred.MoeType.SMR_VSA attribute) (mordred.MoeType.VSA_EState attribute) (mordred.MolecularDistanceEdge.MolecularDistanceEdge attribute) (mordred.MolecularId.MolecularId attribute) (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia attribute) (mordred.MoRSE.MoRSE attribute) (mordred.PathCount.PathCount attribute) (mordred.PBF.PBF attribute) (mordred.Polarizability.APol attribute) (mordred.Polarizability.BPol attribute) (mordred.RingCount.RingCount attribute) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsCount attribute) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsRatio attribute) (mordred.SLogP.SLogP attribute) (mordred.SLogP.SMR attribute) (mordred.TopologicalCharge.TopologicalCharge attribute) (mordred.TopologicalIndex.Diameter attribute) (mordred.TopologicalIndex.PetitjeanIndex attribute) (mordred.TopologicalIndex.Radius attribute) (mordred.TopologicalIndex.TopologicalShapeIndex attribute) (mordred.TopoPSA.TopoPSA attribute) (mordred.VdwVolumeABC.VdwVolumeABC attribute) (mordred.VertexAdjacencyInformation.VertexAdjacencyInformation attribute) (mordred.WalkCount.WalkCount attribute) (mordred.Weight.Weight attribute) (mordred.WienerIndex.WienerIndex attribute) (mordred.ZagrebIndex.ZagrebIndex attribute)

parameters() (mordred.Descriptor method) PathCount (class in mordred.PathCount) PBF (class in mordred.PBF) PEOE_VSA (class in mordred.MoeType) PetitjeanIndex (class in mordred.TopologicalIndex) PetitjeanIndex3D (class in mordred.GeometricalIndex) PNSA (class in mordred.CPSA) PPSA (class in mordred.CPSA) preset() (mordred.Descriptor class method)

R

Radius (class in mordred.TopologicalIndex) Radius3D (class in mordred.GeometricalIndex) RASA (class in mordred.CPSA) register() (mordred.Calculator method) register_json() (mordred.Calculator method) require_3D (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex attribute) (mordred.ABCIndex.ABCIndex attribute) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount attribute) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount attribute) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix attribute) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount attribute) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount attribute) (mordred.AtomCount.AtomCount attribute) (mordred.Autocorrelation.AATS attribute) (mordred.Autocorrelation.AATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.ATS attribute) (mordred.Autocorrelation.ATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.GATS attribute) (mordred.Autocorrelation.MATS attribute) (mordred.BalabanJ.BalabanJ attribute) (mordred.BaryszMatrix.BaryszMatrix attribute) (mordred.BCUT.BCUT attribute) (mordred.BertzCT.BertzCT attribute) (mordred.BondCount.BondCount attribute) (mordred.CarbonTypes.CarbonTypes attribute) (mordred.CarbonTypes.FractionCSP3 attribute) (mordred.CarbonTypes.HybridizationRatio attribute) (mordred.Chi.Chi attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalMean attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalSum attribute) (mordred.CPSA.DPSA attribute) (mordred.CPSA.FNSA attribute) (mordred.CPSA.FPSA attribute) (mordred.CPSA.PNSA attribute) (mordred.CPSA.PPSA attribute) (mordred.CPSA.RASA attribute) (mordred.CPSA.RNCG attribute) (mordred.CPSA.RNCS attribute) (mordred.CPSA.RPCG attribute) (mordred.CPSA.RPCS attribute) (mordred.CPSA.RPSA attribute) (mordred.CPSA.TASA attribute) (mordred.CPSA.TPSA attribute) (mordred.CPSA.WNSA attribute) (mordred.CPSA.WPSA attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourIndex attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourMatrix attribute) (mordred.DistanceMatrix.DistanceMatrix attribute) (mordred.EccentricConnectivityIndex.EccentricConnectivityIndex attribute) (mordred.EState.AtomTypeEState attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaBranchingIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCompositeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCoreCount attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaBeta attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaFunctionalityIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount attribute) (mordred.FragmentComplexity.FragmentComplexity attribute) (mordred.Framework.Framework attribute) (mordred.GeometricalIndex.Diameter3D attribute) (mordred.GeometricalIndex.GeometricalShapeIndex attribute) (mordred.GeometricalIndex.PetitjeanIndex3D attribute) 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S

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T

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V

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W

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Z

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ZModifiedIC (class in mordred.InformationContent)