Welcome to mordred’s documentation!

Contents:

• Introduction
• mordred-community
  • Installation
  • Packages using mordredcommunity
  • Number of Descriptors
• Examples
  • calculate all descriptors
  • save to file (display progress bar)
  • stream read (low memory, no number of molecules information)
  • only ABCIndex
  • ABCIndex and AcidBase
  • multiple input
  • show help
  • as library
  • Additional Examples
• Citation
• mordred package
  • Result
    • Result.fill_missing()
    • Result.drop_missing()
    • Result.items()
    • Result.keys()
    • Result.values()
    • Result.asdict()
    • Result.ix
    • Result.name
  • Descriptor
    • Descriptor.mol
    • Descriptor.preset()
    • Descriptor.parameters()
    • Descriptor.to_json()
    • Descriptor.calculate()
    • Descriptor.dependencies()
    • Descriptor.as_argument
    • Descriptor.mol
    • Descriptor.coord
    • Descriptor.fail()
    • Descriptor.rethrow_zerodiv()
    • Descriptor.rethrow_na()
    • Descriptor.from_json()
  • Calculator
    • Calculator.from_json()
    • Calculator.register_json()
    • Calculator.to_json()
    • Calculator.config()
    • Calculator.descriptors
    • Calculator.register()
    • Calculator.echo()
    • Calculator.map()
    • Calculator.pandas()
  • get_descriptors_in_module()
  • Subpackages
    • mordred.error
    • mordred.descriptors
    • mordred.surface_area
  • Submodules
    • mordred.ABCIndex module
    • mordred.AcidBase module
    • mordred.AdjacencyMatrix module
    • mordred.Aromatic module
    • mordred.AtomCount module
    • mordred.Autocorrelation module
    • mordred.BCUT module
    • mordred.BalabanJ module
    • mordred.BaryszMatrix module
    • mordred.BertzCT module
    • mordred.BondCount module
    • mordred.CPSA module
    • mordred.CarbonTypes module
    • mordred.Chi module
    • mordred.Constitutional module
    • mordred.DetourMatrix module
    • mordred.DistanceMatrix module
    • mordred.EState module
    • mordred.EccentricConnectivityIndex module
    • mordred.ExtendedTopochemicalAtom module
    • mordred.FragmentComplexity module
    • mordred.Framework module
    • mordred.GeometricalIndex module
    • mordred.GravitationalIndex module
    • mordred.HydrogenBond module
    • mordred.InformationContent module
    • mordred.KappaShapeIndex module
    • mordred.Lipinski module
    • mordred.LogS module
    • mordred.McGowanVolume module
    • mordred.MoRSE module
    • mordred.MoeType module
    • mordred.MolecularDistanceEdge module
    • mordred.MolecularId module
    • mordred.MomentOfInertia module
    • mordred.PBF module
    • mordred.PathCount module
    • mordred.Polarizability module
    • mordred.RingCount module
    • mordred.RotatableBond module
    • mordred.SLogP module
    • mordred.TopoPSA module
    • mordred.TopologicalCharge module
    • mordred.TopologicalIndex module
    • mordred.VdwVolumeABC module
    • mordred.VertexAdjacencyInformation module
    • mordred.WalkCount module
    • mordred.Weight module
    • mordred.WienerIndex module
    • mordred.ZagrebIndex module
• atomic properties
• Matrix aggregating methods
  • SpAbs
  • SpMax
  • SpDiam
  • SpAD
  • SpMAD
  • LogEE
  • SM1
  • VE1
  • VE2
  • VE3
  • VR1
  • VR2
  • VR3
• Descriptor List

Indices and tables

• Index

• Module Index

• Search Page